課程資訊
課程名稱
高通量技術概論與數據分析
Introduction to high-throughput technique and data analysis 
開課學期
105-2 
授課對象
醫學院  基因體暨蛋白體醫學研究所  
授課教師
張以承 
課號
Genom7008 
課程識別碼
455 M0080 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五3,4(10:20~12:10) 
上課地點
 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。地點:基因體5樓505室。與江士昇、周祐吉、鄭婷仁、毛溪山、徐唯哲、姚文萱、陳逸然、楊振翔合開。與李弘元、郭錦樺、陳沛隆、潘思樺、盧子彬合開
總人數上限:30人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1052Genom7008_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

生物體複雜度極高, 現代生物醫學逐漸由”hypothesis-driven”轉成”hypothesis-free”, 高通量技術將成為必備之知識, 整個基因組乃至於整個國家, 都成為分析的目標, 本課程介紹常用全基因組定序, 轉錄體, 蛋白體學, 與代謝體學方法。並介紹全基因組RNAi/CRISPER 篩選, 全基因組基因剔除小鼠資源, 高通量小分子藥物篩選, 虛擬分子對接, 與人體生物醫學資料庫乃至於與全民健保資料庫的連結。課程除了技術概論, 還包含數據分析之基本原理。 

課程目標
熟悉實驗室常用高通量技術之原理與分析技巧 
課程要求
簽到(50%)、報告(40%)、課堂討論 (10%) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
Nature Biotechnology: Computational Biology Primers http://www.liacs.nl/~hoogeboo/mcb/nature_primer.html 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
簽到 
50% 
 
2. 
報告 
40% 
 
3. 
課堂討論 
10% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/24  1. Introduction to basic concept 
第2週
3/03  2. Genome-wide association and linkage analysis 
第3週
3/10  3. cDNA microarray (I) 
第4週
3/17  4. cDNA microarray (II) 
第5週
3/24  5. Genome-wide RNAi screening/CRISPER 
第6週
3/31  6. High-throughput small molecule screening (I) 
第7週
4/07  7. High-throughput small molecule screening (II) 
第8週
4/14  8. Molecular docking 
第9週
4/21  9. Next-generation sequencing (I) 
第10週
4/28  10. Next-generation sequencing (II) 
第11週
5/05  11. Next-generation sequencing (III) 
第12週
5/12  12. Proteomics (I) 
第13週
5/19  13. Proteomics (II) 
第14週
5/26  14. Metabolomics (I) 
第15週
6/02  15. Metabolomics (II) 
第16週
6/09  16. Data Integration 
第17週
6/16  17. Discussion